Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CMC2Q9NRP2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMC2Q9NRP2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.1 ms