Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO8Q9NRD0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO8Q9NRD0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.4 ms