Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BPIFA1Q9NP55 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BPIFA1Q9NP55 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms