Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsmQ9JL96 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CtsmQ9JL96 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms