Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Lmx1aQ9JKU8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmx1aQ9JKU8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.3 ms