Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Herpud1Q9JJK5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Herpud1Q9JJK5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms