Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riox1Q9JJF3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Riox1Q9JJF3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Riox1Q9JJF3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms