Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

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Length 742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sv2aQ9JIS5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sv2aQ9JIS5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms