Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LratQ9JI60 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LratQ9JI60 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LratQ9JI60 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LratQ9JI60 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LratQ9JI60 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LratQ9JI60 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms