Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3GQ9HC16 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms