Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCLRE1BQ9H816 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCLRE1BQ9H816 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms