Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snap29Q9ERB0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.9 ms