Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfcp2Q9ERA0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfcp2Q9ERA0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms