Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hmg20aQ9DC33 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20aQ9DC33 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms