Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cbx6Q9DBY5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cbx6Q9DBY5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx6Q9DBY5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cbx6Q9DBY5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 317.5 ms