Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Swt1Q9DBQ9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Swt1Q9DBQ9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Swt1Q9DBQ9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms