Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SrpraQ9DBG7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrpraQ9DBG7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrpraQ9DBG7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.7 ms