Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8L0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8L0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D8L0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8L0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8L0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8L0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8L0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8L0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8L0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D8L0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms