Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrp2bpQ9D4C6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrp2bpQ9D4C6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrp2bpQ9D4C6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrp2bpQ9D4C6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrp2bpQ9D4C6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrp2bpQ9D4C6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrp2bpQ9D4C6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrp2bpQ9D4C6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrp2bpQ9D4C6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrp2bpQ9D4C6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrp2bpQ9D4C6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrp2bpQ9D4C6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrp2bpQ9D4C6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrp2bpQ9D4C6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrp2bpQ9D4C6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lrp2bpQ9D4C6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lrp2bpQ9D4C6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrp2bpQ9D4C6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms