Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms