Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramef12Q9D2F1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.6 ms