Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan11Q9D1D1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan11Q9D1D1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms