Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Zcchc8Q9CYA6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms