Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp23Q9CX11 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp23Q9CX11 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp23Q9CX11 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp23Q9CX11 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp23Q9CX11 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp23Q9CX11 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms