Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930553M12RikQ9CUH1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930553M12RikQ9CUH1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms