Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhobtb3Q9CTN4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhobtb3Q9CTN4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms