Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc96Q9CR92 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc96Q9CR92 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc96Q9CR92 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms