Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc43Q9CR29 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc43Q9CR29 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms