Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Atp6v0e1Q9CQD8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Atp6v0e1Q9CQD8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Atp6v0e1Q9CQD8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Atp6v0e1Q9CQD8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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