Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ14

Trpd52l3, Tumor protein D52-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpd52l3Q9CQ14 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trpd52l3Q9CQ14 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpd52l3Q9CQ14 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms