Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE4

SELENOS, Selenoprotein S, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOSQ9BQE4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOSQ9BQE4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENOSQ9BQE4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms