Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe41Q99PV5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Bhlhe41Q99PV5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe41Q99PV5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 246.5 ms