Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim3Q99PE5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms