Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp4Q99ME9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gtpbp4Q99ME9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms