Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lysmd3Q99LE3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lysmd3Q99LE3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms