Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ophn1Q99J31 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ophn1Q99J31 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ophn1Q99J31 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms