Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDNQ99608 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NDNQ99608 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDNQ99608 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDNQ99608 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDNQ99608 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDNQ99608 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDNQ99608 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDNQ99608 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDNQ99608 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDNQ99608 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDNQ99608 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDNQ99608 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDNQ99608 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDNQ99608 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDNQ99608 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDNQ99608 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDNQ99608 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDNQ99608 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDNQ99608 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDNQ99608 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDNQ99608 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDNQ99608 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDNQ99608 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDNQ99608 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDNQ99608 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDNQ99608 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDNQ99608 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDNQ99608 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDNQ99608 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDNQ99608 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDNQ99608 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDNQ99608 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDNQ99608 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDNQ99608 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDNQ99608 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDNQ99608 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDNQ99608 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDNQ99608 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDNQ99608 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDNQ99608 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NDNQ99608 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDNQ99608 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NDNQ99608 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDNQ99608 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDNQ99608 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDNQ99608 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NDNQ99608 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDNQ99608 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDNQ99608 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDNQ99608 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDNQ99608 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDNQ99608 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDNQ99608 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDNQ99608 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NDNQ99608 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDNQ99608 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDNQ99608 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDNQ99608 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDNQ99608 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDNQ99608 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDNQ99608 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDNQ99608 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDNQ99608 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDNQ99608 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDNQ99608 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDNQ99608 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDNQ99608 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDNQ99608 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDNQ99608 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDNQ99608 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDNQ99608 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDNQ99608 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDNQ99608 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDNQ99608 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDNQ99608 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDNQ99608 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDNQ99608 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDNQ99608 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDNQ99608 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDNQ99608 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDNQ99608 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDNQ99608 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDNQ99608 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDNQ99608 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDNQ99608 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDNQ99608 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDNQ99608 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDNQ99608 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDNQ99608 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDNQ99608 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDNQ99608 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDNQ99608 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDNQ99608 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDNQ99608 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDNQ99608 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDNQ99608 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDNQ99608 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDNQ99608 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDNQ99608 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms