Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACAP3Q96P50 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACAP3Q96P50 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACAP3Q96P50 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACAP3Q96P50 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACAP3Q96P50 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACAP3Q96P50 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACAP3Q96P50 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACAP3Q96P50 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACAP3Q96P50 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACAP3Q96P50 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACAP3Q96P50 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACAP3Q96P50 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACAP3Q96P50 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACAP3Q96P50 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACAP3Q96P50 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ACAP3Q96P50 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACAP3Q96P50 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACAP3Q96P50 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACAP3Q96P50 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACAP3Q96P50 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACAP3Q96P50 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACAP3Q96P50 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACAP3Q96P50 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACAP3Q96P50 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACAP3Q96P50 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACAP3Q96P50 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACAP3Q96P50 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACAP3Q96P50 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACAP3Q96P50 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACAP3Q96P50 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACAP3Q96P50 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACAP3Q96P50 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ACAP3Q96P50 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACAP3Q96P50 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ACAP3Q96P50 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.8 ms