Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPRD1AQ96P16 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPRD1AQ96P16 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPRD1AQ96P16 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms