Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRRC1Q96M27 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms