Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C8orf48Q96LL4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C8orf48Q96LL4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms