Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PGBD1Q96JS3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PGBD1Q96JS3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms