Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms