Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3KBP1Q96B97 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3KBP1Q96B97 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms