Protein–RNA interactions for Protein: Q925J9

Med1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med1Q925J9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Med1Q925J9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Med1Q925J9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Med1Q925J9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Med1Q925J9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Med1Q925J9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Med1Q925J9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Med1Q925J9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Med1Q925J9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Med1Q925J9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Med1Q925J9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Med1Q925J9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Med1Q925J9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Med1Q925J9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Med1Q925J9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Med1Q925J9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Med1Q925J9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Med1Q925J9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Med1Q925J9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Med1Q925J9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Med1Q925J9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Med1Q925J9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms