Protein–RNA interactions for Protein: Q923P0

Col20a1, Collagen alpha-1(XX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col20a1Q923P0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col20a1Q923P0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col20a1Q923P0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col20a1Q923P0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms