Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spdl1Q923A2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spdl1Q923A2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms