Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf3Q922U1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf3Q922U1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf3Q922U1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms