Protein–RNA interactions for Protein: Q91WM3

Rrp9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp9Q91WM3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rrp9Q91WM3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rrp9Q91WM3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp9Q91WM3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms