Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usb1Q91W78 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Usb1Q91W78 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usb1Q91W78 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.5 ms